Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms