Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms