Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPCQ01831 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPCQ01831 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPCQ01831 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPCQ01831 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPCQ01831 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPCQ01831 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPCQ01831 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPCQ01831 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
XPCQ01831 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPCQ01831 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPCQ01831 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPCQ01831 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPCQ01831 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms