Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms