Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms