Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms