Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms