Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms