Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI35P80217 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI35P80217 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFI35P80217 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms