Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX3P78415 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX3P78415 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX3P78415 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX3P78415 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX3P78415 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms