Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms