Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms