Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RND3P61587 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RND3P61587 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RND3P61587 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RND3P61587 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms