Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms