Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms