Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00313P59037 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms