Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEFSECP57772 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms