Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK1P57059 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK1P57059 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIK1P57059 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK1P57059 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK1P57059 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK1P57059 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms