Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH15P55291 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH15P55291 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms