Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP7P55210 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP7P55210 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP7P55210 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms