Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATN1P54259 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATN1P54259 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATN1P54259 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATN1P54259 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATN1P54259 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATN1P54259 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATN1P54259 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATN1P54259 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms