Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARSP54136 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARSP54136 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARSP54136 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARSP54136 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARSP54136 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARSP54136 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARSP54136 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARSP54136 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARSP54136 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARSP54136 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARSP54136 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARSP54136 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARSP54136 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARSP54136 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARSP54136 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms