Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms