Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RORCP51449 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RORCP51449 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RORCP51449 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RORCP51449 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RORCP51449 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RORCP51449 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RORCP51449 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RORCP51449 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RORCP51449 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RORCP51449 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms