Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms