Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQGAP1P46940 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms