Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRATP43155 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRATP43155 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRATP43155 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRATP43155 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms