Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTTP42858 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTTP42858 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTTP42858 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTTP42858 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTTP42858 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTTP42858 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTTP42858 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms