Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP2P42575 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP2P42575 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP2P42575 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP2P42575 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP2P42575 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP2P42575 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP2P42575 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms