Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms