Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms