Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBRP36941 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBRP36941 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBRP36941 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBRP36941 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBRP36941 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBRP36941 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBRP36941 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBRP36941 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBRP36941 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBRP36941 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms