Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM23P36406 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms