Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRS3P32247 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms