Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1CAMP32004 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms