Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms