Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GCAP28676 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GCAP28676 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GCAP28676 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GCAP28676 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GCAP28676 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GCAP28676 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GCAP28676 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GCAP28676 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GCAP28676 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GCAP28676 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GCAP28676 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GCAP28676 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms