Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms