Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRGP23470 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms