Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NF1P21359 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NF1P21359 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NF1P21359 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms