Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms