Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASTP20810 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASTP20810 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASTP20810 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASTP20810 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASTP20810 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASTP20810 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASTP20810 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASTP20810 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASTP20810 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASTP20810 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASTP20810 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASTP20810 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms