Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms