Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms