Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCFC2P16383 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms