Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms