Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRP12270 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPRP12270 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPRP12270 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPRP12270 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPRP12270 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRP12270 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRP12270 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms