Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHGAP10645 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHGAP10645 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHGAP10645 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms