Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI2P10070 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI2P10070 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI2P10070 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI2P10070 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI2P10070 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI2P10070 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI2P10070 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI2P10070 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI2P10070 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI2P10070 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI2P10070 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI2P10070 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI2P10070 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI2P10070 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI2P10070 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI2P10070 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI2P10070 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI2P10070 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms