Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms